研究报告

马尾松候选基因 EST-SSR 引物开发  

龚桂芳1 , 冯源恒2 , 安琪1 , 杨章旗2*
1 广西师范大学生命科学学院, 桂林, 541006; 2 广西壮族自治区林业科学研究院, 广西马尾松工程技术研究中心, 广西优良用材林资源培育重点实验室, 南宁, 530002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 28 篇   
收稿日期: 2019年10月07日    接受日期: 2019年11月15日    发表日期: 2021年01月06日
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摘要

松脂产量是马尾松的重要经济性状,通过开展候选基因关联分析获得与产脂性状具有较强相关性的遗传标记,进行分子标记辅助选择,是加快马尾松产脂性状改良进程的一种可行方法。该研究通过对马尾松高产脂无性系与普通产脂无性系的针叶、顶芽和韧皮部 3 个组织进行转录组差异分析,并根据所得差异序列开发 SSR 引物,为马尾松产脂性状候选基因关联分析研究提供分子标记。经分析共在 6 个样本的 124 345Unigene 序列中发现 14 461 SSR 位点。根据表达差异基因序列含有 SSR 的位点设计开发了 259 EST-SSR 引物,其中 147 对引物可扩增出清晰条带,引物的有效性为 56.76%;有 65 对引物表现出多态性,多态率为 25.10%,可用于进行马尾松产脂性状候选基因关联分析。本研究所开发的 EST-SSR 引物为今后马尾松的关联分析研究、分子标记辅助育种研究等提供可靠的标记,并为马尾松产脂性状关键基因的挖掘提供参考依据。
 

关键词
马尾松(Pinus massoniana);转录组;SSR;关联分析;引物开发

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《分子植物育种》印刷版
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